Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl13P47963 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms