Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfkmP47857 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfkmP47857 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfkmP47857 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfkmP47857 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfkmP47857 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms