Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsfP46460 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsfP46460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NsfP46460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NsfP46460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NsfP46460 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NsfP46460 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NsfP46460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsfP46460 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsfP46460 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsfP46460 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsfP46460 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsfP46460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsfP46460 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsfP46460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsfP46460 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsfP46460 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsfP46460 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsfP46460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsfP46460 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsfP46460 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsfP46460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsfP46460 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsfP46460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsfP46460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsfP46460 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms