Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlx1P43345 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms