Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NodalP43021 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NodalP43021 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NodalP43021 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NodalP43021 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NodalP43021 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NodalP43021 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NodalP43021 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NodalP43021 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NodalP43021 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NodalP43021 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NodalP43021 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NodalP43021 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NodalP43021 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NodalP43021 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms