Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timp3P39876 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Timp3P39876 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms