Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf1P39428 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf1P39428 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf1P39428 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms