Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig1P37913 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig1P37913 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms