Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sar1aP36536 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms