Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddit3P35639 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms