Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin1P35438 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin1P35438 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms