Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh15P33146 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh15P33146 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms