Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Marcksl1P28667 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms