Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NapbP28663 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NapbP28663 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NapbP28663 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NapbP28663 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NapbP28663 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NapbP28663 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NapbP28663 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NapbP28663 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NapbP28663 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NapbP28663 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NapbP28663 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NapbP28663 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NapbP28663 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NapbP28663 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NapbP28663 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NapbP28663 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NapbP28663 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NapbP28663 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NapbP28663 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NapbP28663 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NapbP28663 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NapbP28663 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NapbP28663 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NapbP28663 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms