Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aco1P28271 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aco1P28271 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aco1P28271 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms