Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfraP26618 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms