Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChgaP26339 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChgaP26339 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChgaP26339 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChgaP26339 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms