Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RdxP26043 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RdxP26043 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RdxP26043 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RdxP26043 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RdxP26043 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RdxP26043 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RdxP26043 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RdxP26043 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RdxP26043 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RdxP26043 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RdxP26043 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RdxP26043 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RdxP26043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RdxP26043 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RdxP26043 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RdxP26043 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RdxP26043 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RdxP26043 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RdxP26043 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RdxP26043 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RdxP26043 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RdxP26043 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RdxP26043 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RdxP26043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RdxP26043 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RdxP26043 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RdxP26043 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RdxP26043 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RdxP26043 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms