Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkchP23298 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkchP23298 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkchP23298 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkchP23298 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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