Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnc1P19123 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms