Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18532 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18532 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18532 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P18532 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18532 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18532 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18532 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18532 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18532 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18532 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18532 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18532 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18532 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms