Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ca3P16015 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ca3P16015 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ca3P16015 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ca3P16015 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca3P16015 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca3P16015 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms