Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgbP16014 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgbP16014 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgbP16014 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgbP16014 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgbP16014 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms