Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-D1P14427 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-D1P14427 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms