Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkar1bP12849 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1bP12849 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms