Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fv4P11370 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms