Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms