Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Amd1P0DMN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms