Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms