Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01792 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01792 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01792 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01792 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01792 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01792 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01792 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01792 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01792 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms