Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01727 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01727 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01727 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01727 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01727 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01727 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01727 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01727 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01727 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01727 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01727 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms