Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01643 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01643 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01643 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01643 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01643 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01643 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01643 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01643 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01643 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01643 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01643 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01643 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01643 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01643 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01643 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01643 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01643 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01643 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01643 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01643 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01643 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms