Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifnb1P01575 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms