Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin7bO88951 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin7bO88951 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin7bO88951 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms