Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apaf1O88879 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Apaf1O88879 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms