Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp23O88676 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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