Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pak1O88643 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms