Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dync1i1O88485 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dync1i1O88485 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms