Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfdp1O88271 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfdp1O88271 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfdp1O88271 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms