Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10509O88255 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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