Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec11aO88200 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec11aO88200 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms