Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtogO55225 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OtogO55225 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OtogO55225 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
OtogO55225 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OtogO55225 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
OtogO55225 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OtogO55225 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OtogO55225 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OtogO55225 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtogO55225 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtogO55225 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtogO55225 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtogO55225 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtogO55225 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtogO55225 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms