Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2a2O55143 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2a2O55143 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms