Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap1O55125 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap1O55125 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms