Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3O55013 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms