Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole2O54956 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole2O54956 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms