Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarce1O54941 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms