Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffaO54786 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffaO54786 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffaO54786 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffaO54786 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffaO54786 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffaO54786 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffaO54786 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffaO54786 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DffaO54786 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffaO54786 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DffaO54786 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DffaO54786 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DffaO54786 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DffaO54786 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DffaO54786 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DffaO54786 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DffaO54786 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DffaO54786 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DffaO54786 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DffaO54786 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DffaO54786 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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