Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cavin1O54724 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cavin1O54724 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms