Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccr6O54689 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms